Baumbunker bieten einen unverdichteten Baumstandort unter befestigten Flächen wie Gehwegplatten, Asphalt und Ähnlichem. Dadurch wird das Anheben der Pflasterung verhindert, ein häufiges Problem bei druckverteilenden Lösungen wie Baumgranulat und Baumsubstratsand. Pflasterhebungen können hohe Unterhaltungskosten verursachen, während Baumbunker diese Kosten vermeiden. Da Wurzelaufdruck verhindert und Regenwasser lokal bewirtschaftet wird, sind die Unterhaltungskosten von Baumbunkern im Vergleich zu anderen Systemen geringer.
Das System hat jedoch auch einige Nachteile. Beim Einsatz von Baumbunkern in Gebieten mit hohem Grundwasserstand, wie beispielsweise in Amsterdam, kann die Anwendung technisch anspruchsvoll und weniger kosteneffizient sein. Dennoch sind Lösungen möglich, und in solchen Situationen werden Baumbunker eingesetzt, wenn die Vermeidung von Wurzelaufdruck eine Voraussetzung ist. Außerdem sind Baumbunker bei bestehenden Bäumen schwierig anzuwenden. Die Installation rund um bestehende Bäume mit einem umfangreichen Wurzelsystem ist nahezu unmöglich. Eine gute Vorbereitung und erfahrene Fachkräfte sind dann notwendig, dennoch bleibt es eine riskante Aufgabe.